تسنیم/ سازمان حسابرسی کشور از تصرف بیش از ۶ هکتار اراضی فرودگاه شیراز توسط شهرداری خبر داد و اعلام کرد: ۱۳۵ فقره اسناد مالکیت زمین و ساختمان به نام شرکت فرودگاهها نیست.

در بخشی از گزارش سازمان حسابرسی از عملکرد شرکت فرودگاهها و ناوبری هوایی ایران در سال 1402 آمده است؛
«... 61330 متر از اراضی فرودگاه شیراز مورد تصرف شهرداری قرار گرفته است که بر اساس پیگیری حقوقی انجام شده در سنوات قبل، شهرداری به پرداخت 330 میلیارد ریال بابت بهای زمین به شرکت محکوم شده است. اما  اقدامی در جهت مراحل واگذاری و دریافت مابه ازای آن صورت نپذیرفته است.
همچنین بخشی را از زمین‌های شرکت در تهران و شهرستان ها در اختیار سایر اشخاص و سازمان‌ها از جمله گمرک، شهرداری، شرکت هواپیمایی جمهوری اسلامی و.... قرار دارد.
مضافاً در سال قبل بخشی از زمین‌های فرودگاه مشهد با زمین‌های آستان قدس رضوی معاوضه و مبلغ 294 میلیارد ریال سرک پرداخت شده است. در این خصوص مدارک و مستندات از جمله نحوه واگذاری ارزش‌گذاری متراژ واگذار و تصرف شده به این سازمان ارائه نشده است.
علاوه بر این صورت‌ریز زمین‌های شرکت بر اساس لیست اموال با دفاتر قابل انطباق نبوده و در مواردی اسناد مالکیت اراضی فاقد متراژ و حدود و ثغور مشخصات تعیین شده و تعداد 135 فقره اسناد مالکیت زمین و ساختمان به نام شرکت نیست. در نتیجه حصول اطمینان از صحت تمامیت ثبت اموال مذکور در دفاتر برای این سازمان میسر نشده است. 
مضافاً تعداد 64 فقره از ساختمان‌های شرکت در فرودگاه‌ها فاقد پایان کار صادره از سوی شهرداری‌ها هستند که تعهدات احتمالی آن مشخص نیست.
ضمناً بابت قرار داد BOT پارکینگ طبقاتی ترمینال 2 با "شرکت فرودیار بلند پایه سامانه ایرانیان" بر اساس رای هیئت تشخیص شرکت به پرداخت 447 میلیارد ریال ملزم شده که تاکنون تعیین و تکلیف نشده است.  در چنین شرایطی تعیین آثار احتمالی ناشی از دسترسی به مستندات لازم بر صورت‌های مالی مقدور نیست.»