وی به عنوان اولین مدرس مربیگری فوتسال فدراسیون جهانی فوتبال، FIFA از قاره آسیا و نیز تنها مدرس زن آسیا در پنل مدرسان نخبه کنفدراسیون فوتبال آسیا، AFC است.

مظفر در سال 1384 به عنوان اولین مربی تیم ملی فوتبال بانوان ایران پس از انقلاب شکوهمند اسلامی( 1357) برگزیده شد و تا سال 1389 در این سمت باقی ماند.

در سال 1389 پس از جدایی از تیم ملی فوتبال، به عنوان سرمربی تیم ملی فوتسال بانوان ایران انتخاب شد و تا سال 1393 در تیم ملی مشغول فعالیت بود. 

از مهم‌ترین دستاوردهای وی در این دوران، کسب عنوان نایب قهرمانی در مسابقات داخل سالن آسیا 2013 در کشور کره جنوبی بود که در زمان هدایت وی اولین مدال نقره زنان ایران در تاریخ (قبل و پس از انقلاب) در بخش ورزش‌های توپی گروهی به دست آمد.

وی در مقطعی دیگر و در سال 1396 مجدداً به این سمت برگزیده شد و این بار با تیم ملی فوتسال بانوان ایران به عنوان قهرمانی آسیا دست یافت.

مظفر با تیم ملی فوتسال بانوان ایران به مقام قهرمانی در مسابقات غرب آسیا در سال 1391، نایب قهرمانی در مسابقات داخل سالن آسیا در سال 1392، عنوان سوم در مسابقات داخل سالن آسیا در سال 1396 و قهرمانی در مسابقات جام ملت‌های آسیا در سال 1397 دست یافته و از این حیث پر افتخارترین مربی ملی محسوب می‌شود.

شهرزاد مظفر مربیگری تیم‌های مختلف باشگاهی در لیگ برتر فوتسال ایران را از آغاز تأسیس در سال 1384 تا سال 1397 به عهده داشته‌است و با شش عنوان قهرمانی به عنوان پرافتخارترین مربی لیگ برتر ایران نیز شناخته می‌شود.

او از سال 1397 با عقد قراردادی، سکان هدایت تیم ملی فوتسال بانوان کویت را در دست گرفت و امروز با تصمیم فدراسیون فوتبال به عنوان سرمربی دختران فوتسال ایران به خانه بازگشت.